血清白蛋白（Serum Albumin）

人類血清中的蛋白質，含量最多的就是白蛋白（Albumin），約莫在 3.5 - 5.5 gm/dL (公克/100mL)、50 - 60% 的血清蛋白都是Albumin。立體結構如下：

Superimposition of five albumins, including 4L8U, 2XVV, 1HK3, 1HK5, and 1E7I

Albumin擁有許多功能，像是平衡血液的滲透壓、幫助攜帶不易溶於水的分子例如說脂肪酸、止痛藥ibuprofin等。相關的結構與功能可參考PDB 101上面的文章《Serum Albumin》、更多的詳細的說明可參考Albumin.org，中文的看林怡萱寫的《血清白蛋白》

雖然說albumin佔血清中這麼多的比例，但是先天性缺乏白蛋白（Congenital analbuminaemia）居然不是致命的!! 這篇文章解釋說，白蛋白的部分功能可以由血液中高濃度的非白蛋白質，與循環系統自我調整來補足；雖說並不致命，但還是會造成一些複雜的狀況像是lipodystrophy與hypercholesterolaemia，也可能會導致atherosclerosis。

Albumin.org可以找到豐富的白蛋白相關資訊。此網站一開始是Theodore Peters, Jr.做的，但現在管理已經轉給Ulrich Kragh-Hansen, University of Aarhus, Denmark與Lorenzo Minchiotti and Monica Campagnoli, University of Pavia, Italy。此網站上面介紹了白蛋白：

• 臨床上的應用
• 人類白蛋白的特性與結構
• 與白蛋白結合的小分子：像fatty acids, bilirubin and hemin, thyroid hormones, retinol and retinoic acids, uremic toxins, nitric oxide (NO), Cu2+ and Ni2+, 過度金屬離子, resveratro, 鈍氣等等。
• 新陳代謝與相關的化合物
• 一些白蛋白的應用
• 遺傳學上的研究、已經知道的遺傳變異列表
• 有紀錄的Analbuminemia案例
• 導致Analbuminemia的突變

文章首圖的製作過程

開啟PyMOL，下指令：
PyMOL> fetch 4L8U 2XVV 1HK3 1HK5 1E7I

PyMOL> cealign 1E7I, 1HK5
RMSD 0.445861 over 576 residues
PyMOL> rms_cur (1E7I and n. n+ca+o), (1HK5 and n. n+ca+o)
 Executive: RMS =    0.524 (1742 to 1742 atoms)

PyMOL> cealign 1E7I, 1HK3
RMSD 4.560436 over 544 residues
PyMOL> rms_cur (1E7I and n. n+ca+o), (1HK3 and n. n+ca+o)
 Executive: RMS =    4.317 (1674 to 1674 atoms)

PyMOL> cealign 1E7I, 2XVV
RMSD 0.538433 over 576 residues
PyMOL> rms_cur (1E7I and n. n+ca+o), (2XVV and n. n+ca+o)
 Executive: RMS =    0.604 (1742 to 1742 atoms)

PyMOL> cealign 1E7I, 4L8U
RMSD 0.815510 over 576 residues
PyMOL> rms_cur (1E7I and n. n+ca+o), (4L8U and n. n+ca+o)
 Executive: RMS =    0.876 (1745 to 1745 atoms)

可以看到cealign算出來的RMSD不太一樣，猜測是因為cealign這指令只有計算對到的residues，而且還不知道用的是所有的atoms還是backbone atoms去算RMSD

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