手動安裝FastQC-0.11.9到指定目錄

FastQC是一套用來看定序品質的軟體，用的是Java，所以首先要安裝Java Environment。在Debian8.8下面一個比較簡單的方式是先用下面指令安裝APT上面預設的fastqc，這樣就會自然地把環境給設定好。

Step 1：安裝好FastQC需要的環境

sudo apt install fastqc
sudo apt install libcommons-math3-java libjbzip2-java libsam-java picard-tools
java -version

這樣做完後會就會看到Java JDK的版本

java version "1.7.0_111"
OpenJDK Runtime Environment (IcedTea 2.6.7) (7u111-2.6.7-2~deb8u1)
OpenJDK 64-Bit Server VM (build 24.111-b01, mixed mode)