含有正序全部5個母音的英文單字

英文全部5個母音是 a, e, i, o, u，要找到這些母音依序出現的英文單字：

• cat /usr/share/dict/words | \
  grep -E "[aA]+[^aeiouAEIOU]*[eE]+[^aeiouAEIOU]*[iI]+[^aeiouAEIOU]*[oO]+[^aeiouAEIOU]*[uU]+" | \
  xargs -n4 -d'\n'

這邊用到兩個操作子：

• ^：代表否定
• *：代表存在0個到多個字母

在這個資料庫裡面總共有54個，每4個一行列出來如下：

含有五個母音最短與最長的英文單字

英文字母裡面含有五個母音且最短和最長的單字，用下面的指令：

• cat /usr/share/dict/words | \
  grep -ivE '^([^a]*|[^e]*|[^i]*|[^o]*|[^u]*)$' | \
  awk '{print length " " $0}' | \
  sort -n | head -n 20
• cat /usr/share/dict/words | \
  grep -ivE '^([^a]*|[^e]*|[^i]*|[^o]*|[^u]*)$' | \
  awk '{print length " " $0}' | \
  sort -n | tail -n 20

PDB中最常出現的氨基酸片段

想要知道五個連續氨基酸出現次數用下面兩個指令就可以得到：

1. wget ftp://ftp.wwpdb.org/pub/pdb/derived_data/pdb_seqres.txt
2. cat pdb_seqres.txt | grep -e "mol:protein" -A 1 \
   | sed '/^--$/d' | grep -v "^>" \
   | awk '{while(length($0)>=5){print substr($0,1,5);gsub(/^./,"")}}' \
   | grep X -v | sort | uniq -c | sort -k 1 -n -r \
   > prot_sorted_5peptide.count

第1個指令是下載當前所有PDB檔案序列pdb_seqres.txt，約122MB
第2個指令是計算個數的檔案，結果存在prot_sorted_5peptide.count裡面，計算的時間約莫是五分鐘，下面是分析的指令：

大量搬移帳號

在Linux上面想要將A機器上面的帳號搬移到B機器上面，又不想要改密碼，可以藉由修改 /etc/passwd 與 /etc/shadow 兩個檔案來完成。

首先，用下面的指令根據UID來排序A機器上面的帳號：

• sort -n -t ':' -k3 /etc/passwd

假設要移動的使用者帳號的UID從1111到2222，首先用下面的指令來看B機器上面有沒有UID從1111到2222的使用者

• sort -n -t ':' -k3 /etc/passwd | awk -F ":" '$3>=1111 {print}' | awk -F ":" '$3<=2222 {print}'

確定B機器沒有上述帳號以後，才能安心地把帳號從A機器搬到B機器。這時候要在A機器上面把這些帳號印出來：

1. sort -n -t ':' -k3 /etc/passwd | awk -F ":" '$3>=1111 {print}' | awk -F ":" '$3<=2222 {print $1}'
2. sort -n -t ':' -k3 /etc/passwd | awk -F ":" '$3>=1111 {print}' | awk -F ":" '$3<=2222 {print $1}' | tr '\n' '|' | sed s'/.|$/\n/'

上面第1個指令是僅僅印出來帳號名稱、一行一個帳號，第二個指令則是變成egrep可以讀的pattern，這樣才能夠用下面的egrep指令將A機器裡面的 /etc/shadow 裡面的資料給抓出來：

• sudo egrep -E `sort -n -t ':' -k3 /etc/passwd | awk -F ":" '$3>=1111 {print}' | awk -F ":" '$3<=2222 {print $1}' | tr '\n' '|' | sed s'/.|$/\n/'` /etc/shadow

最後把上述指令印出來的帳號相關資訊附加到到B機器的/etc/shadow檔案後面，這樣就完成從A機器大量搬移帳號到B機器，而且還不需要改密碼~

參考資料

• How to shave off last character using sed? 
• How to grep with a list of words
• How to use “:” as awk field separator?
• Grep lines for numbers greater than given number

_EOF_

Ubuntu 16.04僅更新安全性套件

Ubuntu登入時，都會通知是否有套件需要更新、其中有幾個屬於安全性更新。若想要知道究竟哪些套件屬於安全性更新，下指令：

• apt-get -s dist-upgrade |grep "^Inst" |grep -i security 

若要安裝這些安全性更新套件，則是以root的身份下指令：

• apt-get -s dist-upgrade | grep "^Inst" | grep -i security | awk -F " " {'print $2'} | xargs apt-get --yes install

看執行程式的預設路徑（PATH）

在類UNIX系統裡面，想要看預設哪些資料夾下的指令可以直接跑，輸入

• echo $PATH
• echo $PATH | tr ':' '\n'

兩者出來的結果是一樣的，只是下面行指令比較好讀。若要知道某個指令現在是哪個路徑來的，則是使用which或是type這個指令：

• which python
• ls -l `which python`
• type python

_EOF_

計算網頁被某個IP瀏覽過的次數

最近某個寫的網頁似乎被用程式不斷的query，造成系統資源吃太多。去/var/log/apache2裡面檢查 error.log 與 access.log 與 other_vhosts_access.log，看究竟是從哪些IP來連的。下面以 other_vhosts_access.log 為例子：

• cat other_vhosts_access.log | grep -o "[0-9]\{1,3\}\.[0-9]\{1,3\}\.[0-9]\{1,3\}\.[0-9]\{1,3\}" | sort | uniq -c | sort -n
• zcat other_vhosts_access.log.*.gz | grep -o "[0-9]\{1,3\}\.[0-9]\{1,3\}\.[0-9]\{1,3\}\.[0-9]\{1,3\}" | sort | uniq -c | sort -n

用find找檔案

在類UNIX系統（像Linux, Mac, BSD...）下面找檔案的指令叫做find。使用find，可以根據下面幾個檔案的特徵來搜尋：

• 名稱：不一定要全名，可以是某個pattern
• 型態：例如「檔案」、「目錄」、「連結」等等
• 大小：大於或小於多少MB的檔案
• 時間：檔案建立的時間、修改的時間
• 擁有者：檔案由哪些人擁有

開始使用vi與vim

使用UNIX-like系統，一定會用指令列；使用指令列，一定會需要編輯文字。vi（visual editor）就是最常被使用的一種文字編輯器，vim（vi improved）則是vi的改良版。下面的指令意思是使用vim編輯一個叫做parody的文件：

• vim parody

子程序使用的系統資源

前面提到程式可以產生很多子程序，這邊則是說明如何監控這些子程序，進而看要不要刪除這些死掉的程序。

首先執行《Bash的影分身術：Fork》裡面的fork.sh，下面第一個指令是看fork.sh與其產生的子程序的process IDs，第二個指令則是用top看前面20個子程序吃掉的系統資源
$ pgrep fork.sh
$ top -p `pgrep fork.sh | head -n 20 | tr "\\n" "," | sed 's/,$//'`

• top -p：透過process IDs來監控使用資源
• pgrep fork.sh：抓出fork.sh的PID與其子程式的PID
• head -n 20：只取前面20行的PIDs，也可以用 tail -n 20 取後面20行
• tr "\\n" "," ：把很多行變成一行，中間用逗點區隔
• sed 's/,$//'`：把一行中結尾的逗點去除

若想要刪除子程序，可以用下面兩個方式：

• kill `pgrep fork.sh`
• kill `pgrep -P fork.sh的PID`

第一種會刪除所有名字有fork.sh的程序（母程序與子程序都會刪除，名字一樣也會刪除）；第二種則只有刪除子程序，但第二種必須要在母程序還沒有被終止前才有用

_EOF_