Mac用open指令選擇編輯器開啟文字檔

在Macintosh使用不同的編輯器開啟文字檔，例如說 ~/.bashrc，指令如下：

1. open ~/.bashrc
2. open -a "Visual Studio Code" ~/.bashrc
3. open -a "Sublime Text" ~/.bashrc

上述指令的意思分別是：

1. 用預設的文字編輯器 TextEditor 開啟文字檔案 ~/.bashrc
2. 用 VSCode (Visual Studio Code) 開啟 ~/.bashrc
3. 用 Sublime 開啟 ~/.bashrc

Sublime Text強調游標所在的行

Sublime Text 3要強調游標所在的行，在Mac上的設定方式如下：

1.  > Sublime Text > Preferences > Settings,
2. 找到 Preferences.sublime-setting – User
3. 加入 "highlight_line": true,  注意要有逗點，設定檔如下

安裝bioSyntax到Sublime Text 3上

bioSyntax是一套幫生物文本資料上色的外掛套件，這邊介紹如何在Windows 10下幫Sublime Text 3這個文字編輯器安裝bioSyntax套件：

1. 安裝Package Control到Sublime
2. 開啟Sublime Text 3 並依照下面步驟依序執行
• 工具列上面選 Preferences > Package Control
• 選擇 Package Control: Install Package （看下圖、點圖放大）
• 搜尋 bioSyntax，點選後會自動安裝
3. 設定讓Windows 10預設用Sublime Text開啟fasta, fastq, bed, gtf, vcf, sam等檔案

安裝Package Control到Sublime

在Sublime上面安裝套件，除了比較麻煩得用手動抓套件下來安裝以外，還可以先安裝套件管理Package Control。安裝步驟如下：

1. 打開Sublime
2. 工具列點選 View > Console （見下圖）
3. 到Package Control上面複製程式碼
4. 把程式碼貼到console的提示符號區，按下Enter

bioSyntax: 為生物文本上色的plugin

bioSyntax:提供文字編輯器的plugin，幫助生物文本上色，可支援的文本：

• .fasta：一般的核酸或是蛋白質序列
• .fastq：Fasta + Phred score檔案，看序列內容與品質
• .clustal：Multiple Sequence Alignment (MSA)
• .bed：基因體範圍規範檔
• .gtf：基因體註解檔案
• .pdb：蛋白質三級結構
• .vcf：Variant Caller Format，標註基因體上面的變異
• .sam：Sequence Alignment Map (SAM) 次世代定序檔

上面是sublime, vim, gedit, less等文字編輯器可看到～