GROMACS將.gro檔案轉成.pdb格式

GROMACS預設的座標存成GRO格式，但一般都會用PDB格式來看。轉換指令為：

• gmx editconf -f xxx.gro -o xxx.pdb

上面的-f是輸入的GRO格式檔名，-o是輸出的PDB格式檔名。editconf這個指令一般是拿來做simulation box的，但還有一些有趣的功能：

• -bt：盒子的樣式，有triclinic, cubic, dodecahedron, octahedron可用
• -d：分子距離盒子最近的距離
• -rotate：旋轉這個分子
• -translate：移動這個分子
• -center：把分子放到盒子的中央

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