AMBER 16用GPU加速分子模擬

AMBER是一套分子模擬的系統，購買的金額隨著身份不同：

• 學術/非營利/政府單位：$500美金
• 營利事業：$20,000美金買，若是從AMBER 14升上來則是$15,000美金

網頁《AMBER 16 GPU ACCELERATION SUPPORT》專門介紹用GPU加速的成果


上面選用的圖是模擬的每一步為一般使用的2 fs，而不是4 fs
測試GPU的機台是 Intel Xeon E5-2620v4 *2，配上各種不同的Nvidia卡（1x代表一張、2x代表兩張......），下面是用的GPU卡片組合：

• 1x V100 PCIE：
• 1x P100 16GB SMX (DGX-1)：
• 1x P100 12GB PCIE：
• 1x P40 PCIE：
• 1x Quadro GP100 PCIE+NVLINK：
• 2x Quadro GP100 PCIE：
• 1x Quadro GP100 PCIE：
• 1x Quadro P6000 PCIE：
• 2x M40：
• 1x M40：
• 2x K80 boards (4 GPUs)：
• 1x K80 boards (2 GPUs)：
• 1/2x K80 boards (1 GPUs)：
• 4x K40：
• 2x K40：
• 1x K40：
• 2x K20：
• 1x K20：
• 1x Titan-V：
• 2x Titan-Xp：the Pascal based Titan-X GPU
• 1x Titan-Xp：
• 2x GTX-1080Ti：
• 1x GTX-1080Ti：
• 2x GTX-1080：
• 1x GTX-1080：
• 2x GTX-1070：
• 1x GTX-1070：
• 4x GTX-Titan-X：
• 2x GTX-Titan-X：
• 1x GTX-Titan-X：the Maxwell based Titan-X GPU
• 1x GTX980Ti：
• 2x GTX980：
• 1x GTX980：
• 2x E5-2697v4 CPU (36 cores)：
• 2x E5-2698v3 CPU (32 cores)：
• 1x E5-2650v3 CPU (20 cores)：

有空再來查一下每張卡的價格......

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