- split_states 1nmr
- for x in cmd.get_names(): cmd.cealign("1nmr_0001///30-70/", x+"///30-70/")
- join_states 1nmr2, 1nmr_*
這邊的例子是Solution Structure of C-terminal Domain from Trypanosoma cruzi Poly(A)-Binding Protein,PDB code是1nmr。指令的意思如下:
- 將1nmr這個結構不同的state(或稱models)分開
分開的物件名稱會變成1nmr_0001, 1nmr_0002, ...... - 將這些分開的結構以1nmr_0001為標準,通通對齊
///30-70/ 的意思是只用30-70的殘基為對齊的標準 - 將1nmr_0001, 1nmr_0002, ......等結構,再次合併成一個叫做1nmr2的結構
參考資料
- PyMOL wiki上的《Split states》
- PyMOL wiki上的《Join states》
- PyMOL用CE alignment來對齊結構
沒有留言:
張貼留言