2016年8月15日 星期一

所有甲型流感病毒的亞型

常聽到的H1N1, H5N1... 等等,是用來分別甲型流感病毒(Influenza A virus)的方式。
  • H:Hemagglutinin (HA),血球凝集素;目前共18種,命名成H1~H18
  • N:Neuraminidase (NA)、神經氨酸酶;目前共11種 ,命名成N1~N11
所以總共會有18*11=198種可能的甲型流感病毒,用一行Bash指令通通列出來:
  • for subtype in H{1..18}N{1..11}; do echo $subtype; done

在這些裡面,真正廣泛流傳在人類裡面只有三種H1N1H1N2H3N2(參考維基百科Human influenza virus一節),但並不是只有這三種才會感染人類,像是H2N2、H5N1、H7N7等等都會感染。

整個甲型流感病毒一萬三千五百多個鹼基,分佈在8條RNA片段內,可以製造出11種不同蛋白質,以下依照片段列出相關的蛋白質(翻譯自維基百科Structurae and genetics一節):
  1. 製作RNA polymerase subunit (PB2)
  2. 製作RNA polymerase subunit (PB1)與PB1-F2蛋白質
  3. 製作RNA polymerase subunit (PA)
  4. 製作Hemagglutinin (HA),HA直接決定流感病毒感染的範圍與劇烈程度。製作一個病毒約莫需要500個HA分子
  5. 製作Nucleoprotein (NP)
  6. 製作Neuraminidase (NA),製作一個病毒約莫需要100個NA分子
  7. 製作兩個matrix proteins (M1 and M2),這兩個分子是用不同的reading frame編碼出來。約莫需要3000個matrix proteins才能製作一個病毒
  8. 製作兩個非結構蛋白質 (NS1 and NEP),一樣是用不同的reading frame來製作
也就是這麼簡單的11種蛋白質就能夠造成大傷亡...

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