最早解出立體結構的蛋白質

多數蛋白質的外觀有著固定的形狀，也就是所謂的立體結構（3D structure）。研究這些結構的學門叫做結構生物學（Structural Biology）。這個學門從1950年代末期開始發展，到1970年代初有一打的蛋白質結構，簡單介紹如下：

• Myoglobin (1mbn)：肌紅素、John Kendrew's structure，1958年得到
• Hemoglobin (2dhb)：血紅素、Max Perutz's structure
• Hemoglobin from lamprey (2lhb)：八目鰻的血紅素，結構介於肌紅素與血紅素之間
• Lysozyme (1lyz)：溶菌酶、DC Philips' structure，1965年解得
• Carboxypeptidase (3cap)：從蛋白質的C端切斷肽鍵（peptide bond）
• Subtilisin (1sbt)：切斷絲氨酸（serine）的肽鍵
• Chymotrypsin (2cha)：切斷含有芳香環的氨基酸，像是酪氨酸（tyrosine）、色氨酸（tryptophan）與苯丙氨酸（phenylalanine）的肽鍵
• Papain (9pap)：木瓜蛋白酶
• Pancreatic trypsin inhibitor (4pti)：胰蛋白酶抑制物，很短的蛋白質
• Oligomeric lactate dehydrogenase (6ldh)：單體型態的乳酸脫氫酶（LDH），當時解出來最大的蛋白質結構。一個單體由334個氨基酸組成，整個LDH則是由四個單體組成的四聚體（tetramer）
• Rubredoxin (4rxn)：含鐵離子的蛋白質，使用四個硫原子來抓住鐵離子
• Cytochrome b5 (1cyo)：還鐵離子的蛋白質，但是用heme group來抓

由於1970年代沒有現代這種網路架構，所以研究人員會把自己解出來的結構數據放到蛋白質資料庫（Protein Data Bank，簡稱PDB）上，由PDB將這些數據“寄”給使用者；後來則是打電話去PDB，請工作人員把存放結構數據的磁帶拿出來，透過數據機來存取資料；現在則是直接上PDB的網站直接下載。目前在PDB上面的結構已經超過12萬個了，目前以一個月一千多個的速度在增加中...

以上文章主要參考David Goodsell寫的《PDB Pioneers》，裡面有許多漂亮的結構
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