2016年5月2日 星期一

Multienzymes

Multienzyme指的是一個蛋白質,但擁有多個活性中心可以催化數個不同的化學反應(參閱G. P. Moss建議的名詞定義。跟著這個定義出現下面三個名詞:
  • Catalytic domain:multienzyme上可以執行催化反應的部分,可以由一個或是多個structural domain組成。
  • Multienzyme complex:multienzyme的catalytic domains在多個polypeptide chains上面。
  • Multienzyme polypeptide:此條polypeptide chain上面包含數個catalytic domains。

根據這個定義,一個protein complex只有一個catalytic domain,但此catalytic domain是由數個subunits的部分所組成的例子不可稱做為multienzyme。對於某一個enzyme上面的一個catalytic domain可以催化多種反映,也不可稱為multienzyme。此外,Multienzyme complex有可能由multienzyme polypeptide組成。

G. P. Moss建議的符號表示法(Symbolism):
  • (A)(B)(C):multienzyme complex,三個catalytic domains在三條polypeptide chains上面
  • (ABC):multienzyme polypeptide,三個catalytic domains在一條polypeptide chain上
  • (A, B, C):multienzyme polypeptide,但是在序列上面的前後順序不知道
  • (A)4:例如哺乳動物的aldolase,四個catalytic domains在四條polypeptide chains上
  • (A)2(B)2:例如E. coli的tryptophan synthase。
  • (ABCDE)2:例如Neurospora crassa粉色麵包黴菌)的arom,enzymes EC 4.6.1.3, EC 4.2.1.10. EC 1.1.1.25, EC 2.7.1.71 and EC 2.5.1.19.
  • {(A)2(B)2}:代表這個complex很穩定(stable,應該跟obligate意思相近)
  • {(A)(B)}2:代表(A)(B)穩定,但是整個complex很鬆散(loose,應該跟transient意思相近)
上面的polypeptide chain在結構中也可以稱做為subunit。上述的建議在1989年提出,那個時候結構應該還沒有像現在這麼多,所以我才猜想為什麼這裡面沒有提到subunit。

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