2016年4月20日 星期三

單鏈構形多態性(SSCP)

單鏈構形多態性:Single-Strand Conformation Polymorphism或是Single-Strand Chain Polymorphism,簡寫成SSCP,在1989年由Orita等人提出用以分離核酸的方法。原理是長度一樣單鏈核酸因為序列不同而使得結構不同,因此可以被電泳給分別出來。圖解參考Lessa & Applebaum的示意圖;後來改良成為PCR-SSCP,實驗步驟與原理可參考這個網頁

這種方法有時候甚至兩條核酸只有一個核苷酸的差異也可以偵測出來。不過SSCP沒有定序給的資訊那麼多,因此現在已經多被定序給取代了。但由於此方法比較便宜,容易用在檢測上面。例如說會用在檢測病毒株之間的差異等等。PCR-SSCP也應用在畜產動物功能性基因的多型性分析上,像是牛、綿羊、豬還有雞等等,詳細請參考畜產試驗所鍾秀枝與林德育寫的《雞基因現況與利用》

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