R套件安裝後存在系統上的位置

安裝在Linux上面的R，可用下面的指令來看library路徑：

• .libPaths()

在Debian裏面預設會顯示（前面的數字代表使用套件的順序、藍色代表在R環境下安裝、綠色代表在系統環境下安裝）：

• [1] "/home/使用者名稱/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1" 
• [2] "/usr/local/lib/R/site-library"
• [3] "/usr/lib/R/site-library"
• [4] "/usr/lib/R/library"

在用library載入套件會由上而下去找。套件放在哪個位置是根據下面的方式判定：

• 一般使用開啟R環境後，用install.packages()去安裝的套件，會放在
  /home/使用者名稱/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.1
• root開啟R環境後，用install.packages()去安裝的套件，存放在
  /usr/local/lib/R/site-library
• root使用apt或是yum去安裝CRAN (r-cran-*)的套件包，安裝在
  /usr/lib/R/site-library
• root使用apt去安裝的core R package，會放在
  /usr/lib/R/library

參考資料

• Where does R store packages?：提到macOS X的位置是不一樣的
• /usr/lib/R/library vs /usr/local/lib/R/site-library：提到Debian R Policy
• Debian Packages of R Software：Debian超詳細說明
• Pathways to R Packages：如何設定R_LIBS_USER與R_LIBS_SITE

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