2018年4月17日 星期二

R的預設資料集DNase

R裡面預設的資料集Elisa assay of DNase,簡稱DNase。這個資料集記錄了大鼠血清裡面的重組蛋白質DNase(recombinant protein DNase),總共有176筆資料、分成三個欄位:
  • Run:重複了幾次的測試。這邊總共跑了11個run,每個run裡面都有16筆資料,所以資料總數是16*11=176
  • concDNase的濃度,是實驗的自變數。每個run裡面同一個濃度都有二次重複,固定了八種濃度,所以每個run的資料數目是2*8=16筆
  • density用ELISA測出來的光學強度,是實驗的應變數

使用範例的指令可以看到conc與density的關係圖
help(DNase)
require(stats)
require(graphics)
coplot(density ~ conc | Run, data = DNase, show.given = FALSE, type = "b")
上面可以看到有11張圖,代表跑了11個runs。每張圖裡面橫軸就是conc(濃度)、縱軸則是ELISA看到的光學強度(density)。

範例裡面有迴歸的例子可以參考使用~有空再來補完這個部分

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