- B:也稱Asx、此位置是Asparagine (N)或Aspartic acid (D)
- Z:也稱Glx、此位置是Glutamine (Q)或Glutamic acid (E)
- X:也稱Xaa代表此位置未知、或是在此位置可以是任何一種氨基酸
- J:也稱Xle,代表此位置是Leucine (L)或Isoleucine (I)
- O:也稱Pyl,全稱Pyrrolysine,第22種氨基酸
- U:也稱Sec,全稱Selenocysteine,第21種氨基酸
英文的26個字母裡面,都被用在氨基酸代稱上。在PDB裡面,B、Z、J、O、U出現次數都很少,例如說:
- ZZVBDAS:出現在1kp0_A與1kp0_B內
- PGMGVOGPETS:出現在1l2q_A與1nth_A內
- PULGCAVH:出現比較多次
在PDB裡面找不到含有編號J的片段~
參考資料
- Wikipedia Table of amino acid abbreviations
- Annex 4 - Amino acids, one and three letter codes
- PDB中最常出現的氨基酸片段
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