計算核酸的濃度

現有一管single strand RNA (ssRNA)溶液1 mL，裡面的ssRNA重量是10 μg (microgram)，序列不知道但長度是41 nucleotides，計算此管ssRNA溶液的濃度：

• 重量濃度：10 μg / 1 mL = 10 * 10^-6 / 10^-3 g/L ＝ 10 * 10^-3 g/L = 10 mg/L

要計算體積莫耳濃度(molarity, M)，需要知道序列的分子量。如果序列已知又會寫Python程式可以參考這篇，不會寫程式的參考《DNA and RNA Molecular Weights and Conversions》，找到"Approximate M.W.'s of Nucleic Acids"這個段落：

• M.W. of ssRNA = (# nucleotides * 320.5) + 159.0 = (41 * 320.5) + 159.0 = 13299.5 g/mol = 13299.5 Daltons

上面公式是計算ssRNA分子量，如果是single-strand DNA或是double-strand DNA用：

• M.W. of ssDNA = (# nucleotides * 303.7) + 79.0
• M.W. of dsDNA = (# nucleotides * 607.4) + 157.9

有了分子量，可以用GraphPad的Molarity Calculator來計算體積莫耳濃度，或用下列公式手動作換算：

• 體積莫耳濃度：10 μg/mL = 10 mg/L = (10 mg/L) / (13299.5 g/mol)
  ≒ 0.0007519 mmol/L = 0.7519 μmol/L = 751.9 nmol/L = 751.9 nM  ≒ 0.75 μM

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