2016年10月31日 星期一

Fedora上安裝Nvidia的驅動程式

舊的MacBookPro5,5,放棄了Ubuntu改裝Fedora(因為比較喜歡Gnome桌面環境,Ubuntu Gnome後來出了一些問題...)。之前要《舊MacBook Pro安裝Ubuntu Gnome後,更新顯示卡驅動 》的動作要重來一次。因為Ubuntu與Fedora兩者差異很大,安裝的方式也相差很多。網路上這篇《Fedora 24/23/22 nVidia Drivers Install Guide》寫的很詳盡,以下是成功的安裝紀錄,指令都用root執行

2016年10月30日 星期日

用遠端桌面連到Fedora的機器

用遠端桌面(Remote Desktop)連Fedora 24。此系統直接進去的桌面環境是Gnome,但遠端連線進去不想要太花俏吃太多資源,所以選擇遠端連線的桌面環境是XFCE。參考bcambl的說明文件《Setup Fedora23 Gnome3 with xRDP via XFCE4》依序執行:


2016年10月29日 星期六

用CE做結構比對

要對齊兩個蛋白質結構,Combinatorial Extension (CE)是其中一種方法。如果只是數個比較,那可以使用網頁版的RCSB PDB Protein Comparison Tool,或是PyMOL裡面內建的cealign指令。但若是要跑很多結構比對,那這樣就必須要下載程式回來自行使用。這個程式到CE其中一位作者Bourne的網頁下面,找到CE Software後下載編譯使用

2016年10月28日 星期五

Windows安裝Python與NumPy

由於Windows並沒有像Mac有MacPorts這樣開源的套件管理工具,所以在安裝Python上面要另外從python.org找軟體來安裝。這篇是2016年的安裝方式,下面的連結則是2017年11月的安裝方式:
建議看上面兩篇的安裝方式即可,後面的方法比較不直覺

Mac安裝Python的NumPy套件

以下介紹如何在Mac上面安裝Python與NumPy套件,使用到的套件管理程式是MacPorts。下面有用到指令的部分請開啟終端機(Terminal)來跑~