2016年2月29日 星期一

PyMOL 版本 1.8.x

看完PyMOL v1.8.x的介紹以後以後,覺得有趣的功能有

  • 計算殘基的暴露程度
  • 直接下載biological unit

2016年2月26日 星期五

升級OS X後,重新安裝Macports

Macports是一個開源軟體的管理系統,運行在蘋果電腦上面。不過因為他不是蘋果公司出產的產品,所以每次作業系統大更新的時候,就變成要重新安裝,上面的軟體也要重新安裝。這次是將Yosemite (10.10)升級成El Capitan (10.11),Josh Smith介紹這次升級好玩的點。

重新安裝的步驟參考Migrating a MacProts installation,在此簡單分成下面四個步驟:
  1. 備份舊版的OS X系統,與舊版的Macports
  2. 升級新OS X系統,並安裝相關應用程式
  3. 重新安裝Macports的基礎系統
  4. 重新安裝Macports管理的開源軟體

2016年2月25日 星期四

Selective sweep

國語:一人得道、雞犬升天 (參考教育部重編國語辭典修訂本)
台語:豬母肥、豬仔囝有肉 (參考台北市多媒體教學諮詢中心)
英文:Success is a relative term. It brings so many relatives. (參考愛給特)
約莫可以說明這種狀況~

在天擇之下,某個有利的突變會增加在擁有這個突變個體的適應性,因此會增加族群裡面的出現的頻率。這些突變附近的基因受益於這個有利的突變所以搭了順風車,也增加了在族群裡面出現的頻率。

2016年2月24日 星期三

Safari下載壓縮檔的時不要自動解壓縮

蘋果電腦的瀏覽器在下載tar.gz或是zip之類壓縮的檔案時,會自動把檔案解壓縮,但有時候還是會有那種希望下載下來不要解壓縮的狀況。例如說:下載某些軟體後要檢查訊息摘要(checksum)時,就不能夠預先解壓縮。

參考Ask Different上的文章«How to stop Safari from unzipping files after download»,有下面兩種解法:

2016年2月23日 星期二

破壞prions的方法

Prions朊毒體是一種蛋白質。比起一般蛋白質更能夠抗消毒劑、高溫、紫外線還有福馬林,但也不是完全無法消滅。下面參考BSEinfo的文章,列出幾種可以消滅或是失活prions的方法。簡單說就是用高溫、化學物質、壓力與時間的組合來達成。