在Mac上安裝BLAST

在自己的Mac主機上跑BLAST，用下面的指令來安裝在/pkg資料夾下：

1. cd /pkg
2. wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.5.0/ncbi-blast-2.5.0+-x64-macosx.tar.gz
3. tar zxf ~/Sources/ncbi-blast-2.5.0+-x64-macosx.tar.gz
4. tree ncbi-blast-2.5.0+/

Bash讀檔案一次讀一行

如果一行裡面沒有空格，可以用for；要不然就用while。比較下面指令的差別：

• for WORD in `cat /etc/passwd`; do echo $WORD; done
• cat /etc/passwd | while read -r LINE; do echo $LINE; done
   
• for WORD in `cat /etc/hosts`; do echo $WORD; done
• cat /etc/hosts | while read -r LINE; do echo $LINE; done

_EOF_

R語言比較兩個vectors的差異

假設有兩個向量（vectors），分別叫做q與t，想要知道這兩個向量是不是一樣，進一步想要知道哪邊不一樣可以用下面的指令：

1. identical(q, t)
2. unique(q)
3. unique(t)
4. unique(q) %in% unique(t)
5. unique(t) %in% unique(q)

爲安裝SSD的Fedora開啟trim

系統是Fedora24，裝在固態硬碟（SSD）上，為了要保護SSD，必須要開啓trim。這邊參考《What is the correct way to setup the fstrim service on an encrypted SSD in Fedora 23?》

根據某欄來篩選Ｒ的資料框架

Ｒ的資料框架（data frame）像是Excel裡面的資料表，參考《操作Ｒ的資料框架（Data frame）》。假設現在要根據某欄位來篩選出新的資料表，可以用subset來達成

• df <- read.csv(file="YOUR_DATA.csv")
• df_sub <- subset(df, df$columnName %in% aVector)

第一行指令是從CSV格式的檔案讀取工作表到df裡面
第二行指令是說，根據df工作表裡面的columnName這個欄位去查aVector，如果有的話就留下來，沒有的話就刪除。

_EOF_