等位基因頻率 vs. 基因型頻率

等位基因頻率（allele frequency, gene frequency）與基因型頻率（genotype frequency）是兩個很容易搞混的族群遺傳學名詞。例如說，某個族群的大小是100，其中某基因的基因型是下面三種：

• AA：25 個體
• Aa：50 個體
• aa：25 個體

族群中個體的數目是 25 + 50 +25 = 100

基因型頻率（genotype frequency）如下：

• f(AA) = 25/100 = .25
• f(Aa) = 50/100 = .50
• f(aa) = 25/100 = .25

等位基因頻率（allele frequency, gene frequency）如下：

• f(A) = (2*25 + 1*50 + 0*25) / (2*100) = 100/200 = .5
• f(a) = (0*25 + 1*50 + 2*25) / (2*100) = 100/200 = .5

上述兩個frequency裡面的數值可以相互推導：

• 已知基因型頻率 要推導出 等位基因頻率：不需要任何假設，直接用genotype frequency來計算，即可得到allele frequency
• 已知等位基因頻率 要推導出 基因型頻率：使用Hardy–Weinberg principle，需要符合此規律的假設才能夠使用allele frequency得到下一代的genotype frequency 

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