2017年8月30日 星期三

2017年8月24日 星期四

用Clonezilla做備份

要做系統備份,可以用再生龍Clonezilla。有兩種做法:
做成兩份是因為,amd64不一定可以支援所有的機器、所以才要做i386, i686-pae, i686這一類的。另外準備一個外接硬碟的,在用USB做備份的時候可以存到這個外接硬碟上面~

在選擇Clonzilla的時候還會有穩定版(stable, Debian-based)與替代版(alternative, Ubuntu-based)這兩種,與要備份的主機板開機方式有關:
  • 穩定版:用在BIOS開機的機器上
  • 替代版:用在uEFI開機的機器上

2017年8月23日 星期三

NFS4的idmapping

對於NFS version4(nfs4),client上面需要從server得到idmapping所需的資訊

例如說user1, uid=1111,那就必須要在nfs server上面有這個使用者,當server用nfs4分享user1的資料夾到client上面的時候,才能夠正確顯示。這可能是因為nfs4在傳送資料夾權限的時候不是用UID,而是用ID,所以才需要用到idmapping

若是分享的資料夾在nfs server上面沒有帳號,則idmapd從server傳送uid對應id表的時候,就會出現nobody

2017年8月22日 星期二

百萬瓦(MW)的耗電量


百萬瓦(MW)的耗電量,意思就是:
  • 一小時會用掉 1000度電:1MW•h = 1000 * 1kW•h = 1000度
  • 一天用掉 24,000度=2.4萬度
  • 一個月用掉 720,000度=72萬度
  • 一年用掉 8,760,000度=876萬度
假設一度電5塊,一個月電費就是360萬,一年的電費就是4320萬

2017年8月21日 星期一

修改GROMACS的.tpr檔案

GROMACS裡面的.tpr檔案(又稱run input file)是跑分子模擬最重要的檔案。這個檔案合併了下面幾項資訊:
  • .gro file:分子結構資訊,每個原子的座標
  • .top file:分子topology資訊,原子在分子如何互相連結的資訊
  • .mdp file:模擬的參數設定
  • .ndx file (optional):原子的index file
要產生這個檔案,要用gmx grompp去把.gro、.top、.mdp檔案合併
要看這個檔案用gmx dump,要修改用gmx convert-tpr去修改,例如說:
  1. gmx convert-tpr -s md.tpr -o md_ca.tpr(選C-alpha)
  2. gmx convert-tpr -s md.tpr -until 20000 -o md_upto_20ns.tpr
  3. gmx dump -s md.tpr > md.tpr.ascii